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Programma dettagliato del primo corso SItEMICRO
Laboratorio di Ecologia Microbica: dalla teoria alla pratica
Martedì 5 Maggio 2009
11:30 Registrazione dei partecipanti, consegna dei poster di presentazione personale
12:30 Meet together brunch presso il CNR-ISE
14:30 Saluti di benvenuto e presentazione del corso (R .Bertoni e comitato scientifico)
15:00 J.M. Gasol - Paradigms in aquatic microbial ecology: how are they changing and what is the future
going to bring us
16:00 Coffee break
16:30 I. Hewson - Molecular microbial ecology: Approaches for examining the assemblage structure and
function of microorganisms
17:30 Presentazione dei partecipanti
18:30 Aperitivo (facoltativo) presso l’Estremadura Cafè
Mercoledì 6 Maggio 2009
..8:45 S. Fazi - Introduzione alla tecnica CARD-FISH
S. Amalfitano - FISH: applicazioni avanzate
10:00 Coffee break
10:30 S. Fazi - CARD-FISH: La permeabilizzazione e l'ibridazione
11:30 M. Tonolla - Identification of microorganisms by MALDI-TOF Mass Spectrometry
12:30 Pausa pranzo
14:30 L. Michaud - Clonaggio di popolamenti batterici: introduzione all’analisi di comunità
15:30 M. Coci - La metagenomica nell'analisi di comunità microbiche complesse
16:30 Coffee break
16:45 G. Corno - L'ARISA come metodo veloce di stima di diversità
17:45 M. Bozzali - Presentazione del Maxwell 16 Promega automated DNA extractor
18:15 Spazio poster
20:00 Cena sociale presso l’Albergo Italia
Giovedì 7 Maggio 2009
..8:30 Gruppo 1: S. Fazi - CARD-FISH: L’amplificazione della fluorescenza e conta cellulare
Gruppo 2: G. Corno - Analisi di un profilo ARISA
10:00 Coffee break
10:15 Gruppo 1: G. Corno - Analisi di un profilo ARISA
Gruppo 2: S. Fazi - CARD-FISH: L’amplificazione della fluorescenza e conta cellulare
11:30 S. Amalfitano - Microscopia ad epifluorescenza ed analisi delle immagini
12:30 Pranzo libero
14:30 R. Casotti - Introduzione alla Citometria a Flusso
15:30 A. Manti - Il citometro: applicazioni avanzate
16:00 Coffee break
16:30 R. Casotti e A. Manti - L'applicazione della citometria a flusso
20:00 Cena e dopocena facoltativi presso l’O’Connors Irish Pub
Venerdì 8 Maggio 2009
..9:30 I. Hewson - Metagenomic and metatranscriptomic investigations into the biogeochemistry of
oligotrophic marine microbial communities
10:30 Coffee break
11:00 Conclusioni
12:00 Saluti finali
In verde sono indicati gli spazi introduttivi, in blu le lezioni teoriche e le esercitazioni teorico/pratiche, in arancione gli eventi collettivi. Alcune lezioni teoriche ed esercitazioni pratiche sia in Aula Tonolli che nei laboratori di ecologia microbica dell'ISE verranno effettuate con i partecipanti divisi in due gruppi che, pertanto, si alterneranno.
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